きっとある。

本論文は、Trypanosoma cruziのオートファジーの紹介です。
Trypanosoma cruziは、中南米アメリカにおいてシャーガス病の原因となるパラサイトです（アフリカのツェツェバエが媒介し馬などでナガナ病を起こすのは、Trypanosoma bruceiです）。
Trypanosoma cruziのGenome projectが終了したことから、著者らはAtg遺伝子の検索を行ないました。その結果、Atg8系（Atg8.1, Atg8.2, Atg4.1, Atg4.2, Atg7, Atg3）は見つかるものの、Atg12系のAtg10, Atg5、Atg12は見つかりませんでした（Atg16はある）。その後、In vitroの生化学的解析からTrypanosoma cruziのAtg4のペプチダーゼ活性を、酵母Atg欠損株への相補実験からTrypanosoma cruziのAtg8系が部分的であるが機能的であることを示しています。ついで、Trypanosoma cruzi Atg8特異的抗体を用いた免疫染色から、Atg8.1がLC3と同様に、大きさ不明ですが飢餓に対応してドット形成すること（II型があるかどうか詳細に見てほしかった）、電子顕微鏡解析から飢餓に対応してオートファゴソーム様構造体が出現することを示しています（Trypanosomaの大きさが50 um程度ですから、1〜5 um程度でしょうか）。さらに、Trypanosoma cruziは昆虫およびヒトの寄生場所や環境に対応して増殖・形態変化を行ないますが、EpimastigotesからMetacyclic trypomastigotesの間におこる形態変化（代謝変化も起こる）時に、LC3のドットがかなり確認されることを示しています。
このパラサイトに対するワクチンはなく、有効な治療法がありません。リソソームにあたるReservosome内のシステインペプチダーゼ・Cuzipainの阻害剤が、Trypanosoma cruziの増殖を抑制することから、オートファジー阻害も有効な治療法になるかもしれないと結んでいる。
スケールバーが無いなど不備な点もありましたが、基本的には信頼のあるデータが揃っていると思われます。ですので、きっと探せばAtg12, Atg10ホモログもあると思います。Atg16もあることですし。