PubMedID | 40441412 |
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タイトル | Structural Insights into Autophagy in the AlphaFold Era. |
ジャーナル | Journal of molecular biology 2025 May;169235. |
著者 | Maruyama T, Noda NN |
- AlphaFoldが描くオートファジーの構造基盤
- Posted by 微生物化学研究会微生物化学研究所 丸山 達朗
- 投稿日 2025/07/03
最近、私たちが執筆したオートファジーに関する総説を紹介させていただきます。
本稿では、オートファジーに関わる約20種類の主要タンパク質について、AlphaFoldによる全原子予測モデルを用いてそれぞれの立体構造の全体像を可能な限り可視化し、複合体形成や分子間相互作用の仕組みを構造レベルで整理しました。
これまでX線結晶構造解析やNMR、クライオ電子顕微鏡などによって各タンパク質の一部構造は報告されてきましたが、柔軟な領域や全長構造、複合体の空間的配置については未解明な点が多く残されています。AlphaFoldの構造予測は、こうした空白を補完し、未解明だった構造や相互作用を可視化することで、オートファジーの分子機構に新たな構造的視点からアプローチする手がかりを提供しています。
なお一部には実験的な検証が必要な点もありますが、構造に基づいてオートファジーの全体像をまとめた内容となっていますので、ご一読いただけましたら幸いです。